Projet PRRI SMART : Une technologie innovante dans le domaine de l’ « Épitranscriptome ».
Le projet SMART (2019-2021), porté par l’Université de Montpellier et le CHU, co-dirigé par le Pr. C. Hirtz (UM/CHU) et le Dr. Alexandre David (IGF), a été financé par la région Occitanie (PRRI) avec les fonds européens pour le développement régional (financement FEDER) à hauteur de 981 433€. Ce projet comprend un chef de projet pour 3 ans (Mme Aurore Attina) et un spectromètre de masse TQ dédié à la réalisation des analyses.
Ce projet PPC-SMART vise donc à développer des méthodes de détection et de quantification par spectrométrie de masse de modifications de l’ARN – prestation unique France – à partir d’échantillons de divers origines (humaine, animale et végétale).
Actuellement, nous détectons 4 nucléosides et 26 nucléosides modifiés au cours d’une analyse LC-MRM de 30 minutes. Et nous continuons à agrémenter cette méthode de nouvelles modifications selon les besoins.
(1) MODOMICS: a database of RNA modification pathways. 2017 update
MSACL 2021 en ligne
Cette année, nous aurons plusieurs présentateurs du CPP sur le congrès MSACL 2021 en ligne. Retrouvez Jana KINDERMANS et Christophe HIRTZ le mardi 14 septembre pour leur présentation sur la réalisation d'un diagnostic haute performance pour la quantification de la...
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Aurore Attina
INGÉNIEURE EN SPECTROMÉTRIE DE MASSE - RESPONSABLE DU PROJET SMART
“Bonjour à tous, je suis ingénieure en spectrométrie de masse et j’ai intégré la PPC comme responsable du projet SMART. Mon rôle est le développement et la mise en place de méthodes pour la détection et la quantification des modifications de l’ARN.”
Amandine Amalric
PhD student
« PhD student working on RNA epigenetic : our goals are to investigate the role of mRNA methylation in colorectal cancer progression and to identify potential RNA modification-based biomarkers in cancer and neurodegenerative diseases using mass spectrometry.” ORCID